近日，继扇贝性染色体进化文章被Nature Ecology & Evolution选为封面文章，中心王师课题组利用日月贝基因组解析扇贝游泳能力进化的文章，也被Genomics, Proteomics & Bioinformatics（5Yr-IF=10.2）选为封面文章！该文章的主要发现是贝类和鸟类通过趋同的基因组小型化方式（即都呈现能量供给通路加强和矿化相关通路减弱），分别获得了游泳和飞行的能力。

该封面采用宋代松涧山禽图为背景，画面中一只飞翔的鸟从天空俯冲下来，扑向一只正在游泳逃跑的日月贝。以此偶联文章两个核心要素（贝类游泳和鸟类飞翔），并寓意躲避天敌促使贝类进化出游泳能力。

整体画面以溪流流向代表进化方向（从右至左），贝类演化经历了从原口动物祖先起始（以寄居蟹从螺壳中探出，寓意即将分演的共同祖先），先与甲壳/蜕皮动物分演（螃蟹、龟足），再从单壳至双壳（鲍鱼/螺→花蛤/扇贝），从埋栖到游泳能力进化（花蛤→扇贝）。贝壳附近DNA序列表征基因组进化方向（如用稀疏的GCTA，代表“Genome S/Cize To smAll”；用紧凑的GCTG，代表“Genome S/Cize Too biG”；用邻近序列的互补性和分叉，代表DNA双螺旋和进化枝分演）。鸟类飞翔能力呈现趋同进化，进化上游的鸟类（离花蛤近些）更为笨拙，而下游的鸟类（离扇贝近些）则具有轻盈飞翔能力。

截至目前，王师课题组已在Nature Ecology & Evolution、Genomics, Proteomics & Bioinformatics等国际基因组学和进化生物学领域知名学术期刊，入选3次封面论文和多次获国际同行专家亮点/专题评述，标志着实验室在动物宏观进化领域不断取得具有重要国际影响力的进展和突破。

论文链接：

Li Y^#, Liu Y^#, Yu H, Liu F, Han W, Zeng Q, Zhang Y, Zhang L, Hu J, Bao Z, Wang S^*. (2022) Adaptive bird-like genome miniaturization during the evolution of scallop swimming lifestyle. Genomics Proteomics & Bioinformatics. https://doi.org/10.1016/j.gpb.2022.07.001

延伸阅读：

• Hughes AL, Hughes MK. (1995) Small genomes for better flyers. Nature. 377: 391.

• Organ CL, Shedlock AM, Meade A, Pagel M, Edwards SV. (2007) Origin of avian genome size and structure in non-avian dinosaurs. Nature. 446: 180-184.