中心发表海洋生物发育演化领域综述:冠轮动物揭开生命多样性起源新篇章!
海洋覆盖了地球表面的71%,孕育了无数生命形式。然而,这些生命的演化发育机制仍未被充分揭示。本文旨在聚焦冠轮动物这一关键类群,揭示海洋生命多样性的演化奥秘,为理解生命的起源和多样性提供新的视角。
导 读
地球作为海洋星球,其丰富的海洋生物多样性为生命演化研究提供了独特资源。然而,科学家长期以来主要侧重于研究陆生模式生物(如果蝇、小鼠),忽视了海洋生物的独特价值。冠轮动物作为海洋中物种最丰富的类群之一,涵盖软体动物(如扇贝、章鱼)、环节动物(如沙蚕)等多个门类,其多样的生命周期和躯体结构为揭示生命演化规律提供了独特的视角。本文系统梳理了近年来利用冠轮动物在物种多样性起源、生活史演化、器官发育起源以及干细胞与再生等方面的前沿研究,为理解生命多样性起源与演化机制提供了崭新的视角。

图1 冠轮动物多维组学研究:解码生命之树的演化密码
组学资源助力海洋生物发育演化认知突破
第三代测序技术、单细胞组学和空间组学等前沿技术的应用,为冠轮动物的研究带来了革命性突破。过去五年中,冠轮动物的染色体级别参考基因组数量增加了21倍,功能基因组数据的爆发与多组学数据库的建立,为研究冠轮动物的基因组演化提供了宝贵资源和工具。在基因组精细图谱的绘制与解析过程中,意外发现冠轮动物基因组展现出显著的古老性和保守性,近乎完美地保存了动物祖先的染色体核型特征,这些创新性的发现为深入理解动物早期起源和发育进化机制提供了一个绝佳的窗口。
物种多样性起源与寒武纪大爆发
寒武纪生命大爆发被称为“生命演化历史上的悬案”,而冠轮动物类群是这一重要历史事件的代表性类群之一。冠轮动物基因组中广泛存在的基因家族扩张和染色体重排,是其形态多样性和演化成功的重要驱动力。Hox基因是动物基因组内高度保守并通常呈簇存在的一类转录因子,在动物体轴形成中起着决定性的作用。研究发现,低等动物Hox基因簇普遍存在一种“分段共线性”的表达方式,这一发现打破了完整基因簇表达应遵循“完全时空共线性”的传统认知,为理解寒武纪动物躯体模式多样化的起源和进化机制提供了关键线索。
生活史演化:先有幼虫(“蛋”)还是先有成体(“鸡”)?
冠轮动物类群的生活史极为丰富多样,其生活史策略的演化被认为是动物界适应性进化成功的关键。然而,海洋幼虫起源问题在国际学术界已争论了百年之久,相对而言,“larva-first”假说得到了学界更广泛的认可。通过对冠轮动物的研究,研究人员惊人地发现,后生动物类群中普遍存在幼虫阶段在其生活史中展现出更为“年轻”的转录组特征,且在后生动物类群中普遍存在。研究结果支持幼虫阶段的进化起源晚于成体阶段,且动物祖先生活史在进化过程中可能仅发生过一次幼虫插入事件。基于这一发现,首次提出了幼虫单次插入起源的“adult-first”模型,革新了传统认知,为深入理解动物的发育调控及宏观演化机制提供了重要的参考。
头足类:挑战传统认知的“外星生物”
头足类动物以其复杂的神经系统和行为能力著称,甚至被惊叹为地球上的“外星生物”。通过解码章鱼基因组,研究人员成功揭示了调控其复杂神经系统发育的关键基因,并发现该分子基础存在与人类高等智能产生不可思议的趋同进化现象。章鱼的发育并不完全遵循DNA的遗传指令,而是通过RNA编辑使其变得更加“聪明”,展现出卓越的模仿能力。这些发现超越了传统“中心法则”的框架,为进化发育学的研究和应用提供了崭新的视角与契机。
干细胞与再生:揭开“不死之身”的奥秘
再生是生物学中的一大谜题。无脊椎类群中普遍存在能促进全身再生的aPSCs(成体多能干细胞),而哺乳动物中其胚胎干细胞中多能性调节机制在发育过程中逐渐丢失。涡虫作为代表性再生模式动物,拥有80%左右与人类同源的基因,却能以惊人的全身再生能力实现了“不死之身”的奇迹。研究发现,涡虫的aPSCs能有效保留多能性调节机制至成体,而aPSCs从新生胚芽重新激活类发育过程则是成体再生的关键,这为再生医学和抗衰老治疗提供了新的启示。
总结与展望
冠轮动物在演化发育生物学(evo-devo)研究中展现出独特魅力,技术进步为其研究带来新的机遇与挑战。未来三大趋势包括:第一,绘制完整“演化地图”:扩大系统发育覆盖度,补齐冠轮动物类群中缺失的基因组数据;第二,解码“暗基因”功能:利用多组学数据库和深度学习分析海量基因数据,挖掘未知基因的功能和应用潜力;第三,打造新型模式生物:开发涡虫、沙蚕、侏儒蛤等新兴模式动物实验室研究体系。这些努力将助力我们揭开生命多样性起源的终极蓝图。

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原文链接:https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S2666675825000724
本文内容来自Cell Press合作期刊The Innovation第6卷第5期以Commentary发表的“Marine evo-devo: New frontiers from Lophotrochozoa” (投稿: 2025-01-05;接收: 2025-03-03;在线刊出: 2025-03-05)。
DOI:10.1016/j.xinn.2025.100869
引用格式:Lian S., Lv J., Li Y., et al. (2025). Marine evo-devo: New frontiers from Lophotrochozoa. The Innovation 6:100869.
作者简介
王 师,中国海洋大学,教授/博导,教育部****特聘教授、国家万人计划领军人才。主要从事贝类基因组学与遗传育种研究,在Nature Methods、Nature Ecology & Evolution(3篇)、Nature Chemical Biology、Nature Protocols(2篇)、Nature Communications等国际权威期刊发表论文上百余篇。成果多次入选海洋领域十大科技进展,获国家技术发明二等奖1项,省部级一等奖2项,教育部青年科学奖,中国动物学会青年科技奖等。
课题组主页:https://www.molevolab.org (中文)
http://www.molevolab.com (英文)
内容转载自<TheInnovation创新>微信公众号