董波课题组在Biological Research上发表最新研究成果
2023年3月11日,Biological Research在线发表了方宗熙海洋生物进化与发育研究中心董波团队题为“DYRK1-mediated phosphorylation of endocytic components is required for extracellular lumen expansion in ascidian notochord”的研究论文。该论文以海鞘脊索管腔为研究对象,揭示了蛋白激酶DYRK1通过磷酸化内吞和胞吐作用的关键组分蛋白,实现对细胞膜合成以及囊泡运输的动态调控,从而维持脊索管腔正常形态发生过程。
生物管遍布于后生动物体内,发挥着物质转运及结构支撑等生物学功能。管状结构的形成对胚胎发生和成体代谢至关重要。先前的研究表明胞吐作用在生物管的形成过程中具有重要作用。然而,内吞作用在生物管形成过程中所扮演的角色仍待阐明。
研究团队首先鉴定到了一个调控脊索管腔膨胀的关键因子dual specificity tyrosine-(Y)-phosphorylation-regulated kinase 1(DYRK1)。抑制DYRK1的激酶活性显著地阻碍了脊索管腔膨胀,表明DYRK1的激酶功能为脊索管腔膨胀所必需。
图1 DYRK1的激酶活性对于脊索管腔的膨胀至关重要
(A)脊索管腔的形态发生。(B)DYRK1激酶活性抑制剂(AZ191,40 μM;Harmine,40 μM;Mirk-IN-1,160 μM)处理抑制脊索管腔的膨胀。(C)管腔直径的数据统计。Bars = 10 μm。
然后,该研究通过磷酸化组学测序以及酵母双杂交等技术手段筛选到了DYRK1的下游蛋白Endophilin。Co-IP 实验证实DYRK1与内吞作用的关键组分Endophilin相互作用,并调控其第263位Ser的磷酸化修饰。体内显性负性突变实验表明Endophilin的磷酸化缺陷抑制脊索管腔的膨胀。磷酸化测序结果显示除Endophilin之外,其他内吞组分的磷酸化修饰也受到DYRK1的调控,暗示着内吞作用受到DYRK1的调控。激酶活性抑制实验结果显示DYRK1功能缺失阻碍了海鞘胚胎的内吞作用,表明DYRK1是内吞作用的上游调控者。随后,该研究证明了内吞作用存在于脊索细胞顶端膜,并且为脊索管腔膨胀所必需。此外,胞吐作用也被证明存在于顶端膜,表明内吞作用与胞吐作用共存于脊索细胞顶端膜。
图2 内吞作用在脊索管腔的膨胀过程中发挥重要作用
(A)DYRK1下游蛋白的筛选。(B)酵母双杂交实验证明DYRK1与Endophilin相互作用。(C)Co-IP实验证明DYRK1与Endophilin相互作用。(D)表达Endophilin(S263A)抑制脊索管腔的膨胀。(E)管腔直径的数据统计。(F)抑制内吞作用阻碍脊索管腔的膨胀。Bars = 10 μm。
基于以上结果,该论文提出了一个调控脊索管腔膨胀的假说。胞吐作用与内吞作用共存于脊索细胞顶端膜,二者共同维持脊索细胞囊泡转运的动态平衡,维持管腔的持续膨胀以及顶端膜面积的稳步增长。而这种平衡受到蛋白激酶DYRK1的调控。DYRK1通过调控内吞组分的磷酸化影响细胞的内吞作用,进而参与维持囊泡分泌与回收的动态平衡。该研究为管腔器官形态发生的调控机制解析提供了重要借鉴。
图3 胞吐与内吞的动态平衡为脊索管腔的膨胀所必需
中国海洋大学博士生欧阳修可为本论文第一作者,董波教授为通讯作者,课题组硕士生吴炳彤、于海燕副教授也参与了本项目工作。研究工作获得了国家重点研发国际科技创新合作专项项目、崂山实验室科技创新项目、中央高校基本科研业务费专项和山东省泰山学者计划等项目资助。
论文链接:https://trebuchet.public.springernature.app/get_content/a700169e-ea4e-442b-99ac-0a87e47686d7