海洋生物遗传学与育种教育部重点实验室邀请山东大学生物信息学方面专家于2011年11月19-20日及26-27日来实验室举行生物信息学实用技术培训讲座。

具体安排如下：

生物信息学实用技术

共22课时，每课时约50分钟

1-2. 生物信息学概述

什么是生物信息学；生物信息学的发展；今天的生物信息学技术可以解决那些问题；为什么要学习生物信息学。

3-4. 生物体内的信息：核酸、蛋白质与代谢物

生物体内信息的储存方式；亲子代之间的信息传递机制；细胞内信息的传递机制；信息传递的纠错机制。

5-6. 基因组测序

传统的基因组测序方法：Sanger测序法和鸟枪法；下一代测序技术：454测序，ion torrent测序，Solexa测序，SoLiD测序。反馈7：基于高通量测序平台(solexa,454等)的序列分析方面的内容，比如全基因组序列拼接和注释,基因分型，基因表达定量分析，基因组比较进化分析等等。

7-8. 核酸数据库

常用核酸数据库的使用技巧；核酸数据库的标注解读。反馈1：对于已经完成全基因组测序的物种，如何找到其详细基因组注释信息以及其mRNA序列？反馈3：常用的在线基因结构预测软件的使用以及结果标注解读。

9-10. 蛋白质数据库与其他数据库

常用蛋白质序列库的使用技巧；常用蛋白质结构数据库的使用技巧；常用代谢数据库的使用技巧。反馈2：Blast序列比对的使用以及结果标注解读（如E值，coverage，identity等的含义）。反馈4：如何将基因较准确地聚类到某基因家族或蛋白质家族中？

11-12. 蛋白质序列算法

蛋白质保守区、功能区的序列特征；各类基序（motif）的预测算法和常用软件。

13-14. 蛋白质结构测定与功能预测

已知注释后分析蛋白质结构与功能的技巧；对已知序列的未知蛋白质结构与功能分析的技巧。

15-16. 蛋白质三维结构预测

蛋白质三结构预测的原理及适用情况；几种最常用的结构预测软件的使用技巧及预测结果评估。

17-18. 蛋白质组学与转录组学

组学可解决问题的介绍与分析；蛋白组学的常见技术与原理；转录组学的常见技术与原理

19-20. 分子进化与系统发生学

物种进化与分子进化；进化树的种类与原理；几种常见构建进化树的软件使用技巧；进化树的分析步骤。反馈5：常用的物种分子鉴定方法详细介绍。

21-22. 蛋白质分子表面性质与相互作用

蛋白质功能与结构的关系；蛋白质相互作用原理；几种最常用蛋白质对接软件的使用技巧。