染色体图谱绘制是遗传学研究的基础内容，对染色体识别、遗传连锁图谱整合以及辅助基因组拼接等研究具有重要意义。虾夷扇贝是一种冷水双壳贝类，是我国北方重要的水产养殖种类。目前，关于虾夷扇贝细胞遗传学研究仍处于起步阶段，仅见几种多拷贝基因的定位，如rDNA、组蛋白H3基因以及脊椎动物端粒序列等，这些研究为虾夷扇贝染色体图谱的绘制提供了重要依据。但是，如果想要获得更加精细的染色体图谱，开发更多的染色体特异性标记是非常必要的。
课题组之前已经构建了虾夷扇贝fosmid基因组文库，该文库包含共计122，880个单克隆，为染色体定位工作提供了富足的探针来源。同时，利用课题组完成的虾夷扇贝全基因组测序结果，我们获得了虾夷扇贝基因组中串联重复序列的分布情况，在以上研究基础上，我们挑选了12个包含串联重复序列的虾夷扇贝fosmid克隆，应用荧光原位杂交技术（FISH）对其进行染色体定位。最终6个fosmid克隆被成功定位到了6对不同的虾夷扇贝染色体上，其中，三个克隆被分别定位到了一对中部着丝粒染色体、一对亚中部着丝粒染色体及一对端部着丝粒染色体上，其余三个克隆被定位到了三对不同的亚端部着丝粒染色体上。结合已发表的rDNA定位结果并进行两两克隆的共杂交实验，可以实现虾夷扇贝的8对染色体的区分鉴定。随着更多的fosmid克隆被成功定位到虾夷扇贝染色体上，虾夷扇贝染色体图谱对染色体的识别鉴定、遗传连锁整合以及基因组拼接等工作提供必要依据。
Reference：
Xuan Li, Zujing Yang, Huan Liao, Zhengrui Zhang, Xiaoting Huang, Zhenmin Bao. Chromosomal mapping of tandem repeats in the Yesso Scallop, Patinopecten yessoensis (Jay, 1857), utilizing fluorescence in situ hybridization. Comparative Cytogenetics. 2016. 10(1):157-169.