报告题目：基于多组学数据整合的基因表达调控规律解析

报 告 人：邵振 研究员

中国科学院上海生命科学研究院

马普伙伴计算生物学研究所

摘要

组织细胞的分化发育和病变等过程中往往会有数以千计的基因表现出动态的表达变化，其中涉及到转录和翻译等多个层面的调控。因此，解析基因表达调控的基本规律需要实现多组学数据的整合分析。以合作者建立的人类成红细胞体外定向分化和胚胎干细胞等实验体系为基础，我们系统分析了相关的转录组、表观组和蛋白组等多组学数据，揭示了多个关键通路在其中的调控功能和作用机制。其中，我们搭建了组织特异性增强子元件的功能分析流程，鉴定了控制成人和胚胎阶段红细胞分化的关键增强子和转录因子，揭示了IRF2的阶段特异性调控功能及机制（Developmental Cell 2012），系统构建了控制红细胞分化的核心调控网络（Developmental Cell 2016）；解析了组蛋白去甲基化酶Jmjd2b和Jmjd2c在小鼠胚胎干细胞中的独立和组合调控功能，并阐述了它们对干性维持必不可少的原因（Molecular Cell 2014）；鉴定得到了一种新的PRC2复合体构型，并指出它具有与传统构型相反的调控功能（Molecular Cell 2015）；系统比较分析了人类红细胞分化过程的转录组和蛋白组变化，解析了该过程中转录后表达调控的作用靶基因和分子机制（Nature Cell Biology 2017）。此外，受数据分析需求的驱动，我们还开发了多种组学数据分析的计算模型，包括ChIP-seq数据的定量比较模型MAnorm（Genome Biology 2012）和定量蛋白组数据的统计比较模型MAP（under review at Bioinformatics），并在相关数据的分析工作中得到较好的应用。

时 间：2017.10.31（周二）09:00-11:00

地 点：生命学院化学馆一楼学术厅